輕松的可視化和導(dǎo)航

只需點(diǎn)擊一下geneious，就可以獲得所需的可視化數(shù)據(jù)。 注釋基因組，循環(huán)基因組，映射讀取，重疊群都顯示在我們高度可定制的序列視圖中。 選擇要顯示的其他注釋的著色方案，圖形和軌跡，然后使用動(dòng)態(tài)注釋搜索和位置跳轉(zhuǎn)來(lái)查找您要查找的內(nèi)容。

強(qiáng)大的SNP變異分析

通過(guò)多功能的Geneious算法或眾所周知的FreeBayes查找SNP /變體。 如果您有來(lái)自外部管道或供應(yīng)商的變體調(diào)用，只需拖入VCF即可。 通過(guò)與已知變體進(jìn)行編程比較來(lái)識(shí)別新的變體，或者使用我們的動(dòng)態(tài)表格視圖進(jìn)行排序和過(guò)濾，然后通過(guò)切換到同步序列視圖來(lái)查看基因組上下文。

簡(jiǎn)單的RNA-Seq表達(dá)分析

計(jì)算來(lái)自映射讀取的表達(dá)水平，然后進(jìn)行樣品之間的配對(duì)比較以鑒定差異表達(dá)的基因。 如果沒(méi)有統(tǒng)計(jì)編程語(yǔ)言方面的專(zhuān)業(yè)知識(shí)，R使用行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)DESeq2軟件包比較兩個(gè)條件之間的表達(dá)式，每個(gè)條件都有重復(fù)樣本。

切換到PCA Plot選項(xiàng)卡，使用主成分分析檢查數(shù)據(jù)的質(zhì)量，然后切換到交互式火山圖以發(fā)現(xiàn)感興趣的基因。 在火山圖中選擇一個(gè)基因后，您可以在序列視圖中直接跳到該圖，其中所有基因都根據(jù)差異表達(dá)進(jìn)行熱圖著色。