Geneious軟件插件plugin可用列表
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Geneious可用插件列表
系統(tǒng)發(fā)育
核苷酸分析
- 奧古斯都真菌基因預測與奧古斯都
- 補體/反向補體或逆轉DNA序列，不做兩者兼而有之
- CpG群島通過預測CpG島找到DNA甲基化的目標
- CRT查找細菌和古細菌中的現(xiàn)有CRISPR位點
- EMBOSS Nucleotide預測轉錄因子和蛋白質編碼區(qū)
- FreeBayes單倍型基于FreeBayes的變種發(fā)現(xiàn)。
- 微光預測用Glimmer預測微生物DNA中的基因
- 雜合子通過二級峰調用識別色譜圖中的雜合子
- 微衛(wèi)星簡化微衛(wèi)星基因分型
- Mutate和Shuffle自動改變或隨機播放序列
- Phobos使用Phobos搜索串聯(lián)重復序列/微衛(wèi)星的基因組
- 多態(tài)性SSR使用Phobos在比對中找到多態(tài)性串聯(lián)重復序列
- 重復查找器查找大而遙遠的重復
蛋白質分析
- 卷曲線圈預測蛋白質卷曲螺旋區(qū)域
- EMBOSS蛋白預測二級結構，抗原區(qū)和信號切割位點。
- EMBOSS工具
- InterProScan使用InterPro域自動注釋蛋白質
- PDB結構AlignerPDB蛋白質序列的結構比對
- 跨膜預測蛋白質的跨膜跨越區(qū)域
對準
- Clustal Omega使用Clustal家族的最新成員進行多序列比對。
- LASTZ使用LASTZ對齊大型基因組
- MAFFT使用MAFFT快速準確地進行多序列比對
- Mauve使用Mauve對齊多個基因組以識別大規(guī)模進化事件
- SeqPartitionerPartition等位基因來自多個比對的多重集合
